Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX19P40855 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX19P40855 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX19P40855 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX19P40855 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX19P40855 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX19P40855 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX19P40855 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX19P40855 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX19P40855 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX19P40855 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX19P40855 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX19P40855 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX19P40855 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX19P40855 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX19P40855 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX19P40855 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX19P40855 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX19P40855 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX19P40855 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX19P40855 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX19P40855 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX19P40855 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX19P40855 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX19P40855 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX19P40855 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX19P40855 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX19P40855 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX19P40855 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX19P40855 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX19P40855 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX19P40855 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX19P40855 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX19P40855 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX19P40855 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX19P40855 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX19P40855 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX19P40855 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX19P40855 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX19P40855 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX19P40855 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX19P40855 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX19P40855 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX19P40855 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX19P40855 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX19P40855 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX19P40855 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX19P40855 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX19P40855 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX19P40855 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX19P40855 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX19P40855 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX19P40855 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX19P40855 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX19P40855 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX19P40855 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX19P40855 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX19P40855 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX19P40855 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX19P40855 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX19P40855 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX19P40855 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX19P40855 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX19P40855 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX19P40855 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX19P40855 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX19P40855 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX19P40855 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX19P40855 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX19P40855 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX19P40855 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PEX19P40855 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PEX19P40855 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX19P40855 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX19P40855 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX19P40855 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX19P40855 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX19P40855 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX19P40855 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX19P40855 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PEX19P40855 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PEX19P40855 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms