Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPARGC1BQ86YN6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms