Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 MTHFR-214ENST00000641747 3227 nt11.65□□□□□ -0.542e-9■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.562e-9■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-9■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 CRLF1-203ENST00000594325 1020 ntTSL 325.32■■□□□ 1.647e-8■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 C4A-255ENST00000483974 465 ntTSL 222.96■■□□□ 1.277e-8■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 CRLF1-204ENST00000596360 413 ntTSL 217.81■□□□□ 0.447e-8■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-8■□□□□ 8.1
PCBP1Q15365 UBA52-212ENST00000599256 927 ntTSL 226.14■■□□□ 1.785e-9■□□□□ 8
PCBP1Q15365 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.524e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 HIST1H3J-202ENST00000479986 522 ntTSL 224.41■■□□□ 1.54e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.184e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 SHISA5-214ENST00000486344 713 ntTSL 219.9■□□□□ 0.784e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.648e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 SHISA5-205ENST00000424965 884 ntTSL 518.49■□□□□ 0.554e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.558e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 UBA52-211ENST00000598814 550 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.385e-9■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.278e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.068e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.278e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.398e-21■□□□□ 8
PCBP1Q15365 ALDOA-218ENST00000566146 365 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.784e-36■□□□□ 8
PCBP1Q15365 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 29.15□□□□□ -0.959e-7■□□□□ 8
PCBP1Q15365 KPNB1-213ENST00000583013 742 ntTSL 38.99□□□□□ -0.979e-7■□□□□ 8
PCBP1Q15365 SRRM2-227ENST00000576674 593 ntTSL 48.79□□□□□ -14e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.239e-7■□□□□ 8
PCBP1Q15365 MAN2A2-215ENST00000559704 449 ntTSL 34.92□□□□□ -1.624e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 VASP-205ENST00000588273 318 ntTSL 23.83□□□□□ -1.84e-6■□□□□ 8
PCBP1Q15365 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 214.6□□□□□ -0.078e-71■□□□□ 8
PCBP1Q15365 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 519.53■□□□□ 0.723e-10■□□□□ 8
PCBP1Q15365 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.413e-10■□□□□ 8
PCBP1Q15365 GRK2-203ENST00000524899 751 ntTSL 317.57■□□□□ 0.47e-15■□□□□ 8
PCBP1Q15365 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.323e-10■□□□□ 8
PCBP1Q15365 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.227e-15■□□□□ 8
PCBP1Q15365 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 56.68□□□□□ -1.343e-10■□□□□ 8
PCBP1Q15365 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.833e-10■□□□□ 8
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