Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPARGC1AQ9UBK2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPARGC1AQ9UBK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPARGC1AQ9UBK2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms