Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CFAP74Q9C0B2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CFAP74Q9C0B2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CFAP74Q9C0B2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CFAP74Q9C0B2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CFAP74Q9C0B2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms