Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTKNQ9BST9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTKNQ9BST9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTKNQ9BST9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms