Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNPC3Q96LT9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RNPC3Q96LT9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RNPC3Q96LT9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms