Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CUL4AQ13619 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CUL4AQ13619 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL4AQ13619 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
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