Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 SOD2YHR008C 702 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 ERG27YLR100W 1044 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 SUN4YNL066W 1263 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 PHO85YPL031C 918 nt6.64□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 DUG1YFR044C 1446 nt6.63□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 PIL1YGR086C 1020 nt6.63□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 SPG1YGR236C 288 nt6.63□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 YJL213WYJL213W 996 nt6.63□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 PET117YER058W 324 nt6.62□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 YGL081WYGL081W 963 nt6.62□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 MTR3YGR158C 753 nt6.62□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 GEP5YLR091W 882 nt6.62□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 MSI1YBR195C 1269 nt6.62□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 SCT1YBL011W 2280 nt6.62□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 RHO4YKR055W 876 nt6.61□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 RSC2YLR357W 2670 nt6.61□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 IME2YJL106W 1938 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 MHP1YJL042W 4197 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 ARG81YML099C 2643 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 MTC5YDR128W 3447 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 PEX13YLR191W 1161 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 HST2YPL015C 1074 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 RPL43AYPR043W 279 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 SNT309YPR101W 528 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 HAS1YMR290C 1518 nt6.6□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 DMC1YER179W 1005 nt6.59□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 RIB1YBL033C 1038 nt6.59□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 PAU21YOR394W 495 nt6.59□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 PAU22YPL282C 495 nt6.59□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 YPR127WYPR127W 1038 nt6.59□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 SDH8YBR269C 417 nt6.59□□□□□ -1.35
NFI1Q12216 GPB2YAL056W 2643 nt6.58□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 YML6YML025C 861 nt6.58□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 FAT3YKL187C 2253 nt6.58□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 TDP1YBR223C 1635 nt6.58□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 GEX1YCL073C 1848 nt6.57□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 GEX2YKR106W 1848 nt6.57□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 CTA1YDR256C 1548 nt6.57□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 COX20YDR231C 618 nt6.57□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 DOC1YGL240W 753 nt6.57□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 THR1YHR025W 1074 nt6.57□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 MSN2YMR037C 2115 nt6.56□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 AFG1YEL052W 1530 nt6.56□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 TPO3YPR156C 1869 nt6.56□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 PSR2YLR019W 1194 nt6.56□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 FUS3YBL016W 1062 nt6.56□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 TKL1YPR074C 2043 nt6.55□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 AMN1YBR158W 1650 nt6.55□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 CEM1YER061C 1329 nt6.55□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 PAM17YKR065C 594 nt6.55□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 DPM1YPR183W 804 nt6.55□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 DLD1YDL174C 1764 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 HPT1YDR399W 666 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 YDR401WYDR401W 564 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 OAC1YKL120W 975 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 AIM33YML087C 939 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 YML122CYML122C 381 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 MIX17YMR002W 471 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 RNR3YIL066C 2610 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 ALT1YLR089C 1779 nt6.54□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 EMW1YNL313C 2715 nt6.53□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 YCR049CYCR049C 447 nt6.53□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 TIM22YDL217C 624 nt6.53□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 YTH1YPR107C 627 nt6.53□□□□□ -1.36
NFI1Q12216 FHN1YGR131W 525 nt6.52□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 PUS5YLR165C 765 nt6.52□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 YNR014WYNR014W 639 nt6.52□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 DFR1YOR236W 636 nt6.52□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 HSP104YLL026W 2727 nt6.52□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 MSG5YNL053W 1470 nt6.52□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 MSS1YMR023C 1581 nt6.52□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 SKI2YLR398C 3864 nt6.51□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 IRS4YKR019C 1848 nt6.51□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 MRPL28YDR462W 444 nt6.51□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 COX16YJL003W 357 nt6.51□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 YLR358CYLR358C 564 nt6.51□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 RTC4YNL254C 1206 nt6.51□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 STB5YHR178W 2232 nt6.5□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 HBN1YCL026C-B 582 nt6.5□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 TFB4YPR056W 1017 nt6.49□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 NFS1YCL017C 1494 nt6.48□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 FLC3YGL139W 2409 nt6.48□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 YDL023CYDL023C 321 nt6.48□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 ICS3YJL077C 396 nt6.48□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 RPL5YPL131W 894 nt6.48□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 YOL099CYOL099C 492 nt6.47□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 YOR343CYOR343C 327 nt6.47□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 MCM6YGL201C 3054 nt6.47□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 IMA2YOL157C 1770 nt6.46□□□□□ -1.37
NFI1Q12216 GPT2YKR067W 2232 nt6.46□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 YIR007WYIR007W 2295 nt6.45□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 YPQ2YDR352W 954 nt6.45□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 DUS4YLR405W 1104 nt6.45□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 ATP23YNR020C 813 nt6.45□□□□□ -1.38
NFI1Q12216 MRPS12YNR036C 462 nt6.45□□□□□ -1.38
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