Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YHR145CYHR145C 357 nt7.45□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 SUN4YNL066W 1263 nt7.45□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 TUB1YML085C 1344 nt7.45□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 YCR041WYCR041W 333 nt7.44□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 SNF4YGL115W 969 nt7.44□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 EDC1YGL222C 528 nt7.44□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 ERG27YLR100W 1044 nt7.44□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 NFS1YCL017C 1494 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 OMA1YKR087C 1038 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 TFB4YPR056W 1017 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 UBS1YBR165W 834 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 YBL111CYBL111C 2004 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 DML1YMR211W 1428 nt7.43□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 MHP1YJL042W 4197 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 HDA1YNL021W 2121 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 JJJ3YJR097W 519 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 YOL079WYOL079W 399 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 MCT1YOR221C 1083 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 HAT1YPL001W 1125 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 MPE1YKL059C 1326 nt7.42□□□□□ -1.22 RIP-Chip
PUF3Q07807 CLB5YPR120C 1308 nt7.42□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 SMC5YOL034W 3282 nt7.41□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 TRR2YHR106W 1029 nt7.41□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 AIM2YAL049C 741 nt7.41□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 RTC4YNL254C 1206 nt7.41□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 PUS9YDL036C 1389 nt7.41□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt7.4□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 RCE1YMR274C 948 nt7.4□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 PTH2YBL057C 627 nt7.4□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 YOR268CYOR268C 399 nt7.4□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 PHO85YPL031C 918 nt7.4□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 YPL067CYPL067C 597 nt7.4□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 IDI1YPL117C 867 nt7.4□□□□□ -1.22
PUF3Q07807 CTF3YLR381W 2202 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 TRP4YDR354W 1143 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 DMC1YER179W 1005 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 THR1YHR025W 1074 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 MER1YNL210W 813 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 OAZ1YPL052W 879 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 RFS1YBR052C 633 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YPR127WYPR127W 1038 nt7.39□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt7.38□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt7.38□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 HEL1YKR017C 1656 nt7.38□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YKR023WYKR023W 1593 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 MGR3YMR115W 1506 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 UME1YPL139C 1383 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 ADD66YKL206C 804 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YLR112WYLR112W 420 nt7.37□□□□□ -1.23 RIP-Chip
PUF3Q07807 PRS4YBL068W 981 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 PCL1YNL289W 840 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YNR048WYNR048W 1182 nt7.37□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YPQ1YOL092W 927 nt7.36□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 GET4YOR164C 939 nt7.36□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YPR130CYPR130C 408 nt7.36□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.35□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 MRPS8YMR158W 468 nt7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
PUF3Q07807 PRE5YMR314W 705 nt7.35□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 IRC14YOR135C 342 nt7.35□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 RRS1YOR294W 612 nt7.35□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 DLD1YDL174C 1764 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 PUP2YGR253C 783 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 ERV41YML067C 1059 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 ATO2YNR002C 849 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 YOR012WYOR012W 414 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 PLB2YMR006C 2121 nt7.34□□□□□ -1.23
PUF3Q07807 IRC5YFR038W 2562 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 CTA1YDR256C 1548 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 HPT1YDR399W 666 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 RRP17YDR412W 708 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YGR168CYGR168C 1131 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 ISY1YJR050W 708 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 TAF11YML015C 1041 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 CST26YBR042C 1194 nt7.33□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 HAS1YMR290C 1518 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YPL277CYPL277C 1464 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 TDP1YBR223C 1635 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 MMS2YGL087C 414 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 CYS3YAL012W 1185 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YET2YMR040W 483 nt7.32□□□□□ -1.24 RIP-Chip
PUF3Q07807 GFD1YMR255W 567 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 MBF1YOR298C-A 456 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 BTS1YPL069C 1008 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 SNT309YPR101W 528 nt7.32□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YBR292CYBR292C 372 nt7.32□□□□□ -1.24 RIP-Chip
PUF3Q07807 EHD3YDR036C 1503 nt7.32□□□□□ -1.24 RIP-Chip
PUF3Q07807 UBP13YBL067C 2244 nt7.31□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 SRL2YLR082C 1179 nt7.31□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YIL108WYIL108W 2091 nt7.31□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 BRN1YBL097W 2265 nt7.3□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 MED2YDL005C 1296 nt7.3□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 KRE28YDR532C 1158 nt7.3□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 MTR3YGR158C 753 nt7.3□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 DAL2YIR029W 1032 nt7.3□□□□□ -1.24 RIP-Chip
PUF3Q07807 DCP1YOL149W 696 nt7.3□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 YBR138CYBR138C 1575 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 CIA1YDR267C 993 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 PCL6YER059W 1263 nt7.29□□□□□ -1.24
PUF3Q07807 PDA1YER178W 1263 nt7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.7 ms