Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 EEB1YPL095C 1371 nt6.82□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 PET494YNR045W 1470 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 RSC2YLR357W 2670 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 SKI2YLR398C 3864 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 YGL081WYGL081W 963 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 PIL1YGR086C 1020 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 YJL213WYJL213W 996 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 RPL43AYPR043W 279 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 SDH8YBR269C 417 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 IME2YJL106W 1938 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 MIP1YOR330C 3765 nt6.81□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 TUF1YOR187W 1314 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 GUF1YLR289W 1938 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 EFT2YDR385W 2529 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 EFT1YOR133W 2529 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 YIL055CYIL055C 1884 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 TIF2YJL138C 1188 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 TIF1YKR059W 1188 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 PEX13YLR191W 1161 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 AIM33YML087C 939 nt6.8□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 CSC1YLR241W 2349 nt6.79□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 NAF1YNL124W 1479 nt6.79□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 NMA2YGR010W 1188 nt6.79□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 YJL144WYJL144W 315 nt6.79□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 PAM17YKR065C 594 nt6.79□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 YBL070CYBL070C 321 nt6.79□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 EDC2YER035W 438 nt6.78□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 SWP1YMR149W 861 nt6.78□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 MSI1YBR195C 1269 nt6.78□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 ENP1YBR247C 1452 nt6.78□□□□□ -1.32
YKU80Q04437 ACS1YAL054C 2142 nt6.77□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 RGD1YBR260C 2001 nt6.77□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 LAG2YOL025W 1983 nt6.77□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 QCR6YFR033C 444 nt6.76□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 CIS3YJL158C 684 nt6.76□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 CIT2YCR005C 1383 nt6.75□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 HPT1YDR399W 666 nt6.75□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 ADH5YBR145W 1056 nt6.75□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 NPL6YMR091C 1308 nt6.75□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 IMA5YJL216C 1746 nt6.74□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 FRE5YOR384W 2085 nt6.74□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 COX5AYNL052W 462 nt6.74□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 DPM1YPR183W 804 nt6.74□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 SES1YDR023W 1389 nt6.73□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 DRS1YLL008W 2259 nt6.73□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 TRS31YDR472W 852 nt6.73□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 HIS1YER055C 894 nt6.73□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 YJR107WYJR107W 987 nt6.73□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 YLR358CYLR358C 564 nt6.73□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 CUE4YML101C 354 nt6.73□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 YPL247CYPL247C 1572 nt6.73□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 YML122CYML122C 381 nt6.72□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 MSN2YMR037C 2115 nt6.71□□□□□ -1.33
YKU80Q04437 DMC1YER179W 1005 nt6.71□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 GCN3YKR026C 918 nt6.71□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 KAE1YKR038C 1161 nt6.71□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 DFR1YOR236W 636 nt6.71□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 snR82snR82 268 nt6.7□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 PPM1YDR435C 987 nt6.7□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.7□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 DOC1YGL240W 753 nt6.7□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 POP1YNL221C 2628 nt6.7□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 TPO3YPR156C 1869 nt6.7□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 TOM20YGR082W 552 nt6.69□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 ICS3YJL077C 396 nt6.69□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 TOS6YNL300W 309 nt6.69□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 PZF1YPR186C 1290 nt6.69□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 DEF1YKL054C 2217 nt6.69□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 DPB2YPR175W 2070 nt6.69□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.68□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 YML6YML025C 861 nt6.68□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 NMT1YLR195C 1368 nt6.68□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 HXT15YDL245C 1704 nt6.67□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 HXT16YJR158W 1704 nt6.67□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 YCR049CYCR049C 447 nt6.67□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 YKR032WYKR032W 315 nt6.67□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 TUB1YML085C 1344 nt6.67□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 KTR5YNL029C 1569 nt6.66□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 IES1YFL013C 2079 nt6.66□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 YDL023CYDL023C 321 nt6.66□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 YPQ2YDR352W 954 nt6.66□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 PIH1YHR034C 1035 nt6.66□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 TFB4YPR056W 1017 nt6.66□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 MPE1YKL059C 1326 nt6.66□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 RMD9YGL107C 1941 nt6.66□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.65□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 ERP2YAL007C 648 nt6.65□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 DUS4YLR405W 1104 nt6.65□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 RTC4YNL254C 1206 nt6.65□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 ATP23YNR020C 813 nt6.65□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 SLD7YOR060C 774 nt6.65□□□□□ -1.34
YKU80Q04437 NFS1YCL017C 1494 nt6.65□□□□□ -1.35
YKU80Q04437 RSA4YCR072C 1548 nt6.65□□□□□ -1.35
YKU80Q04437 PMT3YOR321W 2262 nt6.64□□□□□ -1.35
YKU80Q04437 YGR127WYGR127W 939 nt6.64□□□□□ -1.35
YKU80Q04437 ATG23YLR431C 1362 nt6.63□□□□□ -1.35
YKU80Q04437 YMR027WYMR027W 1413 nt6.63□□□□□ -1.35
YKU80Q04437 YDR415CYDR415C 1125 nt6.62□□□□□ -1.35
YKU80Q04437 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.62□□□□□ -1.35
YKU80Q04437 RIX7YLL034C 2514 nt6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms