Protein–RNA interactions for Protein: Q03390

VPS60, Vacuolar protein-sorting-associated protein 60, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS60Q03390 FUS3YBL016W 1062 nt7.22□□□□□ -1.25
VPS60Q03390 KEL1YHR158C 3495 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 HTZ1YOL012C 405 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 DFR1YOR236W 636 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 ERG10YPL028W 1197 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 THI2YBR240C 1353 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 POP1YNL221C 2628 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 RSA4YCR072C 1548 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 RPP1YHR062C 882 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 SMX3YPR182W 261 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 CIA1YDR267C 993 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 TMA46YOR091W 1038 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 SKI2YLR398C 3864 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 CRP1YHR146W 1398 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 GPI11YDR302W 660 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 QCR6YFR033C 444 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 YGL102CYGL102C 429 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 YLL058WYLL058W 1728 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 SQT1YIR012W 1296 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 YLR358CYLR358C 564 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 APE4YHR113W 1473 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 KTR5YNL029C 1569 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 ATG22YCL038C 1587 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 COX9YDL067C 180 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 YGR127WYGR127W 939 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 PRI1YIR008C 1230 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 MOD5YOR274W 1287 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS60Q03390 PET494YNR045W 1470 nt7.15□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 RMD9YGL107C 1941 nt7.15□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 OAC1YKL120W 975 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 MSY1YPL097W 1479 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 COQ1YBR003W 1422 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 HED1YDR014W-A 489 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 HEM2YGL040C 1029 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YIA6YIL006W 1122 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 ERP2YAL007C 648 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YLR123CYLR123C 330 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YNL120CYNL120C 486 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YPQ1YOL092W 927 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 SEC62YPL094C 825 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YEN1YER041W 2280 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 ESC8YOL017W 2145 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 CCC2YDR270W 3015 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YDR514CYDR514C 1452 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 KSH1YNL024C-A 219 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YPL067CYPL067C 597 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YCL049CYCL049C 939 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 VHT1YGR065C 1782 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 ICP55YER078C 1536 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 PDA1YER178W 1263 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YLR312CYLR312C 1197 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 RFC4YOL094C 972 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 STB5YHR178W 2232 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 PEX3YDR329C 1326 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 DMA1YHR115C 1251 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 YLL056CYLL056C 897 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 SWD1YAR003W 1281 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 MRPL19YNL185C 477 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 PFK2YMR205C 2880 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS60Q03390 AFG1YEL052W 1530 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 ASN2YGR124W 1719 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 PIH1YHR034C 1035 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 TRR2YHR106W 1029 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 AIM24YJR080C 1185 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 snR30snR30 606 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 YDR387CYDR387C 1668 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 YML133CYML133C 4125 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 COX10YPL172C 1389 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 VPS61YDR136C 573 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 THI4YGR144W 981 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 ICT1YLR099C 1185 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 PTH2YBL057C 627 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 COQ3YOL096C 939 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 MSC3YLR219W 2187 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 YOS9YDR057W 1629 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 YJR146WYJR146W 354 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 PRS4YBL068W 981 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 RKI1YOR095C 777 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 DOT1YDR440W 1749 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 HXK2YGL253W 1461 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 PAU21YOR394W 495 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 PAU22YPL282C 495 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 HAS1YMR290C 1518 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 PYK2YOR347C 1521 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 MRC1YCL061C 3291 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 MTC5YDR128W 3447 nt7.04□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 MRPL1YDR116C 858 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 OGG1YML060W 1131 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 YNL092WYNL092W 1203 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 MBF1YOR298C-A 456 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS60Q03390 UME1YPL139C 1383 nt7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.7 ms