Protein–RNA interactions for Protein: P39005

KRE9, Cell wall synthesis protein KRE9, yeast

Predictions only

Length 276 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KRE9	P39005	YHR140W	YHR140W	720 nt		5.03	□□□□□ -1.6
KRE9	P39005	RPL2B	YIL018W	765 nt		5.03	□□□□□ -1.6
KRE9	P39005	TAF11	YML015C	1041 nt		5.03	□□□□□ -1.6
KRE9	P39005	AVO2	YMR068W	1281 nt		5.03	□□□□□ -1.6
KRE9	P39005	YNR005C	YNR005C	405 nt		5.03	□□□□□ -1.6
KRE9	P39005	YCL049C	YCL049C	939 nt		5.03	□□□□□ -1.6
KRE9	P39005	TOS2	YGR221C	1869 nt		5.03	□□□□□ -1.6
KRE9	P39005	APE4	YHR113W	1473 nt		5.02	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	CIT3	YPR001W	1461 nt		5.02	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	REV7	YIL139C	738 nt		5.02	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	SPG5	YMR191W	1122 nt		5.02	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	HBN1	YCL026C-B	582 nt		5.02	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	VBA5	YKR105C	1749 nt		5.02	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	SLA2	YNL243W	2907 nt		5.02	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YIL092W	YIL092W	1902 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	PAC2	YER007W	1557 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	LAT1	YNL071W	1449 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	RDN5-2	RDN5-2	119 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	RDN5-3	RDN5-3	119 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	RDN5-4	RDN5-4	119 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	RDN5-5	RDN5-5	119 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	TAF4	YMR005W	1167 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	OPI11	YPR044C	354 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	DPB2	YPR175W	2070 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	ARP3	YJR065C	1350 nt		5.01	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YBR241C	YBR241C	1467 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YPL247C	YPL247C	1572 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	HSM3	YBR272C	1443 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	HSP12	YFL014W	330 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	PTC7	YHR076W	1032 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	CTF8	YHR191C	402 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	LYS12	YIL094C	1116 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	REC107	YJR021C	945 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YLR162W	YLR162W	357 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	RPR1	RPR1	369 nt		5	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YJL045W	YJL045W	1905 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	ELP3	YPL086C	1674 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	snR78	snR78	87 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	FPR2	YDR519W	408 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YEL074W	YEL074W	339 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YIP4	YGL198W	708 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YOX1	YML027W	1158 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YNL234W	YNL234W	1281 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	PET20	YPL159C	762 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	CDC16	YKL022C	2523 nt		4.99	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YMR034C	YMR034C	1305 nt		4.98	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	CDC10	YCR002C	969 nt		4.98	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	TRS31	YDR472W	852 nt		4.98	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	AIM46	YHR199C	933 nt		4.98	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	SUR7	YML052W	909 nt		4.98	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YNR014W	YNR014W	639 nt		4.98	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	YNR048W	YNR048W	1182 nt		4.98	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	CDS1	YBR029C	1374 nt		4.97	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	RPL31B	YLR406C	342 nt		4.97	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	URE2	YNL229C	1065 nt		4.97	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	CTR1	YPR124W	1221 nt		4.97	□□□□□ -1.61
KRE9	P39005	ERP5	YHR110W	639 nt		4.96	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		4.96	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	OPI8	YKR035C	642 nt		4.96	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	DSE3	YOR264W	1293 nt		4.96	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YLL058W	YLL058W	1728 nt		4.96	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	RGD2	YFL047W	2145 nt		4.96	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YJL163C	YJL163C	1668 nt		4.96	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YDL177C	YDL177C	513 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	TRP1	YDR007W	675 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	MRPS28	YDR337W	861 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YFL013W-A	YFL013W-A	804 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YGL102C	YGL102C	429 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YSC83	YHR017W	1158 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	CBR1	YIL043C	855 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	SML1	YML058W	315 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	MRPL24	YMR193W	777 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YOR300W	YOR300W	309 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	ERG10	YPL028W	1197 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	SMX3	YPR182W	261 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	VMA2	YBR127C	1554 nt		4.95	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	AVT4	YNL101W	2142 nt		4.94	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	PRI1	YIR008C	1230 nt		4.94	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YLL056C	YLL056C	897 nt		4.94	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	FIT2	YOR382W	462 nt		4.94	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	SVF1	YDR346C	1446 nt		4.94	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	SKI2	YLR398C	3864 nt		4.94	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	MFG1	YDL233W	1377 nt		4.93	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	PPH22	YDL188C	1134 nt		4.93	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	SHO1	YER118C	1104 nt		4.93	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	MRPL19	YNL185C	477 nt		4.93	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YOL079W	YOL079W	399 nt		4.93	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	ENP1	YBR247C	1452 nt		4.93	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	ICP55	YER078C	1536 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	GTT3	YEL017W	1014 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	RAI1	YGL246C	1164 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	HMS2	YJR147W	1077 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	GCN3	YKR026C	918 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YMR306C-A	YMR306C-A	390 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	ZIM17	YNL310C	525 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	YPR076W	YPR076W	375 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	BUD9	YGR041W	1644 nt		4.92	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	ARO10	YDR380W	1908 nt		4.91	□□□□□ -1.62
KRE9	P39005	SMC5	YOL034W	3282 nt		4.91	□□□□□ -1.62

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