Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIN3BO75182 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3BO75182 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIN3BO75182 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIN3BO75182 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms