Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms