Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
YIPF3Q9GZM5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
YIPF3Q9GZM5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms