Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1CQ96SD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1CQ96SD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms