Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TSC1Q92574 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC1Q92574 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC1Q92574 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSC1Q92574 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms