Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE4DIPQ5VU43 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4DIPQ5VU43 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4DIPQ5VU43 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4DIPQ5VU43 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms