Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YLR042CYLR042C 486 nt9.59□□□□□ -0.87
NCR1Q12200 ISY1YJR050W 708 nt9.58□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YOR325WYOR325W 474 nt9.58□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 SAC7YDR389W 1965 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 OMS1YDR316W 1416 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 GET3YDL100C 1065 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 IGD1YFR017C 588 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 MRP13YGR084C 1020 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YJL032WYJL032W 315 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 SWD2YKL018W 990 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 SNF7YLR025W 723 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 HMX1YLR205C 954 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 INP1YMR204C 1263 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YPL199CYPL199C 723 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 TIP1YBR067C 633 nt9.57□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 SLU7YDR088C 1149 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 MMS2YGL087C 414 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 TAN1YGL232W 870 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 ADH4YGL256W 1149 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YAL064WYAL064W 285 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 SRL2YLR082C 1179 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 GMC2YLR445W 567 nt9.56□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YDL129WYDL129W 876 nt9.55□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 DCG1YIR030C 735 nt9.55□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 OPI3YJR073C 621 nt9.55□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 SHE1YBL031W 1017 nt9.55□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 CTL1YMR180C 963 nt9.55□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 HNT3YOR258W 654 nt9.55□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 VPS62YGR141W 1404 nt9.55□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 APM3YBR288C 1452 nt9.54□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 RHO3YIL118W 696 nt9.54□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 RPB4YJL140W 666 nt9.54□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 MRPS17YMR188C 714 nt9.54□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 FSF1YOR271C 984 nt9.54□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 INA1YLR413W 2028 nt9.54□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 OCH1YGL038C 1443 nt9.54□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 SMF3YLR034C 1422 nt9.54□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.53□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YLR456WYLR456W 615 nt9.53□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 LTO1YNL260C 597 nt9.53□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 YOR062CYOR062C 807 nt9.53□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 KTR4YBR199W 1395 nt9.52□□□□□ -0.88
NCR1Q12200 LSB6YJL100W 1824 nt9.52□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 SPT3YDR392W 1014 nt9.52□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 ADE8YDR408C 645 nt9.52□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YMR010WYMR010W 1218 nt9.52□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 RNH1YMR234W 1047 nt9.52□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 CSG2YBR036C 1233 nt9.52□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YLR108CYLR108C 1458 nt9.52□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 SPT20YOL148C 1815 nt9.52□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YDL086WYDL086W 822 nt9.51□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 HST4YDR191W 1113 nt9.51□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 RNH202YDR279W 1053 nt9.51□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YER186CYER186C 921 nt9.51□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 TIM44YIL022W 1296 nt9.51□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YIL082WYIL082W 873 nt9.51□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt9.51□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YOL162WYOL162W 648 nt9.51□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 DML1YMR211W 1428 nt9.5□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 NPP1YCR026C 2229 nt9.5□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 TGL2YDR058C 981 nt9.5□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 SPR3YGR059W 1539 nt9.5□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 RDI1YDL135C 609 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YEA6YEL006W 1008 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 AIM1YAL046C 357 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YLR194CYLR194C 765 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YPT6YLR262C 648 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 SPS4YOR313C 1017 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 TFB6YOR352W 1032 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 ILV3YJR016C 1758 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 CCT2YIL142W 1584 nt9.49□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 TRS31YDR472W 852 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 RTR1YER139C 681 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YJR114WYJR114W 393 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 RMA1YKL132C 1293 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 GMH1YKR030W 822 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YLR334CYLR334C 381 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YML094C-AYML094C-A 402 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 PRP9YDL030W 1593 nt9.48□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 KXD1YGL079W 657 nt9.47□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 URA5YML106W 681 nt9.47□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 YBL071CYBL071C 309 nt9.47□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 CSI2YOL007C 1026 nt9.47□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 FIG1YBR040W 897 nt9.47□□□□□ -0.89
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