Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 SED5YLR026C 1023 nt7.08□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 MRP7YNL005C 1116 nt7.08□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 BXI1YNL305C 894 nt7.08□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 GLE1YDL207W 1617 nt7.08□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 CLB4YLR210W 1383 nt7.08□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 MET22YOL064C 1074 nt7.07□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 RIX7YLL034C 2514 nt7.07□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 PDC6YGR087C 1692 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 IRS4YKR019C 1848 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 MSN2YMR037C 2115 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 YLR311CYLR311C 348 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 MSO1YNR049C 633 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 HST2YPL015C 1074 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 YPL168WYPL168W 1293 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 POS5YPL188W 1245 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 SAS4YDR181C 1446 nt7.06□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 RKM4YDR257C 1485 nt7.05□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 MSS1YMR023C 1581 nt7.05□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 YPT31YER031C 672 nt7.05□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 AIM2YAL049C 741 nt7.05□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 YPL245WYPL245W 1365 nt7.05□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 HIS7YBR248C 1659 nt7.04□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 snR86snR86 1004 nt7.04□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 YLR036CYLR036C 612 nt7.04□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 YLR283WYLR283W 945 nt7.04□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 TMS1YDR105C 1422 nt7.03□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 DML1YMR211W 1428 nt7.03□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 NMD4YLR363C 657 nt7.03□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 GFD1YMR255W 567 nt7.03□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 YBL111CYBL111C 2004 nt7.03□□□□□ -1.28
SRP1Q02821 SPO12YHR152W 522 nt7.02□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 LEA1YPL213W 717 nt7.02□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 PAP2YOL115W 1755 nt7.01□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 MED2YDL005C 1296 nt7.01□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YIR043CYIR043C 693 nt7.01□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YLR358CYLR358C 564 nt7.01□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 RSC2YLR357W 2670 nt7.01□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 ERG12YMR208W 1332 nt7.01□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 TFC6YDR362C 2019 nt7□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 snR57snR57 88 nt7□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YGR066CYGR066C 879 nt7□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YIR035CYIR035C 765 nt7□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 URA1YKL216W 945 nt7□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 TSR3YOR006C 942 nt7□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 KNS1YLL019C 2214 nt7□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 MAF1YDR005C 1188 nt6.99□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 PUP2YGR253C 783 nt6.99□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 PMU1YKL128C 888 nt6.99□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt6.99□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YMR074CYMR074C 438 nt6.99□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YMR253CYMR253C 1245 nt6.99□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 TIP41YPR040W 1071 nt6.99□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 PSP2YML017W 1782 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 IME2YJL106W 1938 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 RRT6YGL146C 936 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YIL168WYIL168W 384 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YJL009WYJL009W 327 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 OMA1YKR087C 1038 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 ELC1YPL046C 300 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 ECM2YBR065C 1095 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 OPT1YJL212C 2400 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 ERR3YMR323W 1314 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 ERR1YOR393W 1314 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 ERR2YPL281C 1314 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 BSC5YNR069C 1470 nt6.98□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 ABP1YCR088W 1779 nt6.97□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 HER2YMR293C 1395 nt6.97□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 YJR056CYJR056C 711 nt6.97□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 HIS3YOR202W 663 nt6.97□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 AQR1YNL065W 1761 nt6.97□□□□□ -1.29
SRP1Q02821 LAT1YNL071W 1449 nt6.96□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 DRS1YLL008W 2259 nt6.96□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 TRR1YDR353W 960 nt6.96□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 YEA6YEL006W 1008 nt6.96□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 HEM15YOR176W 1182 nt6.96□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 PET112YBL080C 1626 nt6.96□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 MPC54YOR177C 1395 nt6.95□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 EMW1YNL313C 2715 nt6.95□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 YGL235WYGL235W 537 nt6.95□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt6.95□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 VTA1YLR181C 993 nt6.95□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 RNA170RNA170 169 nt6.95□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 RTN1YDR233C 888 nt6.94□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 PEX22YAL055W 543 nt6.94□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 TFB4YPR056W 1017 nt6.94□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 YBR056WYBR056W 1506 nt6.94□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 INM1YHR046C 888 nt6.93□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 SPC42YKL042W 1092 nt6.93□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 CPT1YNL130C 1182 nt6.93□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 RCF2YNR018W 675 nt6.93□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 RHO1YPR165W 630 nt6.93□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 AME1YBR211C 975 nt6.93□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 ARH1YDR376W 1482 nt6.92□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 BUB2YMR055C 921 nt6.92□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 RNH1YMR234W 1047 nt6.92□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 RFA2YNL312W 822 nt6.92□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 NTG2YOL043C 1143 nt6.92□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 CLD1YGR110W 1338 nt6.92□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 ECM30YLR436C 3825 nt6.91□□□□□ -1.3
SRP1Q02821 TKL2YBR117C 2046 nt6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 101.1 ms