Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3BP58499 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3BP58499 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3BP58499 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms