Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSPAN13O95857 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TSPAN13O95857 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPAN13O95857 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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