Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ3

LINC00854, Long intergenic non-protein coding RNA 854, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00854A0A1B0GVQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00854A0A1B0GVQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00854A0A1B0GVQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00854A0A1B0GVQ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00854A0A1B0GVQ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms