Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRMT12Q53H54 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms