Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD20A3Q5VUR7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms