Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VPREB3Q9UKI3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms