Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CGGBP1Q9UFW8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 322.9 ms