Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPARGC1BQ86YN6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARGC1BQ86YN6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms