Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS25Q9BRG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS25Q9BRG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPS25Q9BRG1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms