Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPNS2Q96L46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPNS2Q96L46 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPNS2Q96L46 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CAPNS2Q96L46 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPNS2Q96L46 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAPNS2Q96L46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms