Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC49.4■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.39■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC49.39■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC49.38■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC49.38■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC49.38■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.38■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
RB1CC1Q8TDY2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.37■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.37■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC49.33■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC49.33■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC49.32■■■■■ 5.49
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC49.31■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC49.3■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC49.29■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC49.28■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.28■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC49.28■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
RB1CC1Q8TDY2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC49.24■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC49.23■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC49.2■■■■■ 5.47
RB1CC1Q8TDY2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC49.19■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.16■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC49.15■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC49.13■■■■■ 5.46
RB1CC1Q8TDY2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.12■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.09■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC49.08■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC49.07■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC49.07■■■■■ 5.45
RB1CC1Q8TDY2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC49.03■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC49.01■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC49■■■■■ 5.44
RB1CC1Q8TDY2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC48.99■■■■■ 5.43
RB1CC1Q8TDY2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC48.99■■■■■ 5.43
RB1CC1Q8TDY2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC48.98■■■■■ 5.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms