Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC8Q8TC99 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC8Q8TC99 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC8Q8TC99 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC8Q8TC99 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms