Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM136Q6ZRR5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM136Q6ZRR5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM136Q6ZRR5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM136Q6ZRR5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms