Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GKAP1Q5VSY0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GKAP1Q5VSY0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GKAP1Q5VSY0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GKAP1Q5VSY0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GKAP1Q5VSY0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms