Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 ELP4YPL101W 1371 nt6.96□□□□□ -1.29
HER1Q12276 EFM1YHL039W 1758 nt6.96□□□□□ -1.3
HER1Q12276 HEL1YKR017C 1656 nt6.95□□□□□ -1.3
HER1Q12276 TDH1YJL052W 999 nt6.94□□□□□ -1.3
HER1Q12276 DAL80YKR034W 810 nt6.94□□□□□ -1.3
HER1Q12276 CPR2YHR057C 618 nt6.93□□□□□ -1.3
HER1Q12276 ADE1YAR015W 921 nt6.93□□□□□ -1.3
HER1Q12276 FUS3YBL016W 1062 nt6.93□□□□□ -1.3
HER1Q12276 YPL041CYPL041C 624 nt6.93□□□□□ -1.3
HER1Q12276 ERG24YNL280C 1317 nt6.93□□□□□ -1.3
HER1Q12276 AFG3YER017C 2286 nt6.92□□□□□ -1.3
HER1Q12276 YIL168WYIL168W 384 nt6.92□□□□□ -1.3
HER1Q12276 RRN10YBL025W 438 nt6.92□□□□□ -1.3
HER1Q12276 PET494YNR045W 1470 nt6.92□□□□□ -1.3
HER1Q12276 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.91□□□□□ -1.3
HER1Q12276 CYB2YML054C 1776 nt6.9□□□□□ -1.31
HER1Q12276 YOS9YDR057W 1629 nt6.89□□□□□ -1.31
HER1Q12276 NUP84YDL116W 2181 nt6.88□□□□□ -1.31
HER1Q12276 AGP2YBR132C 1791 nt6.88□□□□□ -1.31
HER1Q12276 ARC35YNR035C 1029 nt6.88□□□□□ -1.31
HER1Q12276 ASN2YGR124W 1719 nt6.87□□□□□ -1.31
HER1Q12276 MCH2YKL221W 1422 nt6.87□□□□□ -1.31
HER1Q12276 ADH6YMR318C 1083 nt6.87□□□□□ -1.31
HER1Q12276 SMK1YPR054W 1167 nt6.87□□□□□ -1.31
HER1Q12276 EHD3YDR036C 1503 nt6.86□□□□□ -1.31
HER1Q12276 MTR3YGR158C 753 nt6.86□□□□□ -1.31
HER1Q12276 OPI1YHL020C 1215 nt6.86□□□□□ -1.31
HER1Q12276 NTG1YAL015C 1200 nt6.86□□□□□ -1.31
HER1Q12276 GFA1YKL104C 2154 nt6.86□□□□□ -1.31
HER1Q12276 NUP53YMR153W 1428 nt6.85□□□□□ -1.31
HER1Q12276 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.85□□□□□ -1.31
HER1Q12276 COS10YNR075W 1125 nt6.85□□□□□ -1.31
HER1Q12276 SNT309YPR101W 528 nt6.85□□□□□ -1.31
HER1Q12276 RPR1RPR1 369 nt6.84□□□□□ -1.31
HER1Q12276 PSP2YML017W 1782 nt6.84□□□□□ -1.31
HER1Q12276 CIT3YPR001W 1461 nt6.84□□□□□ -1.31
HER1Q12276 GPA1YHR005C 1419 nt6.84□□□□□ -1.32
HER1Q12276 ATG22YCL038C 1587 nt6.83□□□□□ -1.32
HER1Q12276 YIP4YGL198W 708 nt6.83□□□□□ -1.32
HER1Q12276 HGH1YGR187C 1185 nt6.83□□□□□ -1.32
HER1Q12276 RPL2BYIL018W 765 nt6.83□□□□□ -1.32
HER1Q12276 STE3YKL178C 1413 nt6.83□□□□□ -1.32
HER1Q12276 YCR061WYCR061W 1896 nt6.82□□□□□ -1.32
HER1Q12276 IDP3YNL009W 1263 nt6.82□□□□□ -1.32
HER1Q12276 VTS1YOR359W 1572 nt6.82□□□□□ -1.32
HER1Q12276 GET2YER083C 858 nt6.81□□□□□ -1.32
HER1Q12276 SHO1YER118C 1104 nt6.81□□□□□ -1.32
HER1Q12276 RGT2YDL138W 2292 nt6.8□□□□□ -1.32
HER1Q12276 ERS1YCR075C 783 nt6.8□□□□□ -1.32
HER1Q12276 CPT1YNL130C 1182 nt6.8□□□□□ -1.32
HER1Q12276 YNL295WYNL295W 1575 nt6.8□□□□□ -1.32
HER1Q12276 INP54YOL065C 1155 nt6.8□□□□□ -1.32
HER1Q12276 REG2YBR050C 1017 nt6.8□□□□□ -1.32
HER1Q12276 BDS1YOL164W 1941 nt6.8□□□□□ -1.32
HER1Q12276 SPR1YOR190W 1338 nt6.79□□□□□ -1.32
HER1Q12276 TAH11YJR046W 1815 nt6.79□□□□□ -1.32
HER1Q12276 HAC1YFL031W 717 nt6.79□□□□□ -1.32
HER1Q12276 SUN4YNL066W 1263 nt6.79□□□□□ -1.32
HER1Q12276 AMN1YBR158W 1650 nt6.79□□□□□ -1.32
HER1Q12276 GSH1YJL101C 2037 nt6.78□□□□□ -1.32
HER1Q12276 CDC7YDL017W 1524 nt6.78□□□□□ -1.32
HER1Q12276 PNS1YOR161C 1620 nt6.78□□□□□ -1.32
HER1Q12276 ERG12YMR208W 1332 nt6.77□□□□□ -1.32
HER1Q12276 ACO1YLR304C 2337 nt6.77□□□□□ -1.33
HER1Q12276 RDR1YOR380W 1641 nt6.77□□□□□ -1.33
HER1Q12276 OPI11YPR044C 354 nt6.77□□□□□ -1.33
HER1Q12276 YBR226CYBR226C 411 nt6.77□□□□□ -1.33
HER1Q12276 EMP65YER140W 1671 nt6.77□□□□□ -1.33
HER1Q12276 MHP1YJL042W 4197 nt6.76□□□□□ -1.33
HER1Q12276 YLL066CYLL066C 3618 nt6.76□□□□□ -1.33
HER1Q12276 CLN1YMR199W 1641 nt6.76□□□□□ -1.33
HER1Q12276 YAL045CYAL045C 309 nt6.76□□□□□ -1.33
HER1Q12276 SKY1YMR216C 2229 nt6.76□□□□□ -1.33
HER1Q12276 YBR241CYBR241C 1467 nt6.75□□□□□ -1.33
HER1Q12276 RSP5YER125W 2430 nt6.75□□□□□ -1.33
HER1Q12276 YDR476CYDR476C 675 nt6.75□□□□□ -1.33
HER1Q12276 PHO85YPL031C 918 nt6.75□□□□□ -1.33
HER1Q12276 ATP4YPL078C 735 nt6.75□□□□□ -1.33
HER1Q12276 CEM1YER061C 1329 nt6.75□□□□□ -1.33
HER1Q12276 NMD5YJR132W 3147 nt6.74□□□□□ -1.33
HER1Q12276 GPH1YPR160W 2709 nt6.74□□□□□ -1.33
HER1Q12276 CTF8YHR191C 402 nt6.74□□□□□ -1.33
HER1Q12276 TDP1YBR223C 1635 nt6.74□□□□□ -1.33
HER1Q12276 RRP43YCR035C 1185 nt6.73□□□□□ -1.33
HER1Q12276 ECM38YLR299W 1983 nt6.73□□□□□ -1.33
HER1Q12276 CCT3YJL014W 1605 nt6.72□□□□□ -1.33
HER1Q12276 MRPL28YDR462W 444 nt6.72□□□□□ -1.33
HER1Q12276 ARA2YMR041C 1008 nt6.72□□□□□ -1.33
HER1Q12276 YPR127WYPR127W 1038 nt6.72□□□□□ -1.33
HER1Q12276 YPT10YBR264C 600 nt6.72□□□□□ -1.33
HER1Q12276 HBN1YCL026C-B 582 nt6.72□□□□□ -1.33
HER1Q12276 URH1YDR400W 1023 nt6.71□□□□□ -1.34
HER1Q12276 LCP5YER127W 1074 nt6.71□□□□□ -1.34
HER1Q12276 YLR122CYLR122C 378 nt6.71□□□□□ -1.34
HER1Q12276 YLR358CYLR358C 564 nt6.71□□□□□ -1.34
HER1Q12276 YMR074CYMR074C 438 nt6.71□□□□□ -1.34
HER1Q12276 YNL017CYNL017C 339 nt6.71□□□□□ -1.34
HER1Q12276 IRC5YFR038W 2562 nt6.71□□□□□ -1.34
HER1Q12276 PGI1YBR196C 1665 nt6.71□□□□□ -1.34
HER1Q12276 ECM30YLR436C 3825 nt6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms