Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 FAR3YMR052W 615 nt7.81□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 PZF1YPR186C 1290 nt7.81□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YER152CYER152C 1332 nt7.8□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 LYS12YIL094C 1116 nt7.8□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YJL043WYJL043W 774 nt7.8□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 PSA1YDL055C 1086 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YJR056CYJR056C 711 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YMR114CYMR114C 1107 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 RTC2YBR147W 891 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YPT10YBR264C 600 nt7.79□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YDR476CYDR476C 675 nt7.78□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 STS1YIR011C 960 nt7.78□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 RMA1YKL132C 1293 nt7.78□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YLR030WYLR030W 792 nt7.78□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 ERV2YPR037C 591 nt7.78□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YNL040WYNL040W 1371 nt7.78□□□□□ -1.16
PUF3Q07807 YBL113CYBL113C 2379 nt7.77□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 PPZ2YDR436W 2133 nt7.77□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 GNA1YFL017C 480 nt7.77□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 SPE4YLR146C 903 nt7.77□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 PEX12YMR026C 1200 nt7.77□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 DCR2YLR361C 1737 nt7.77□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 TPI1YDR050C 747 nt7.76□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 OPI1YHL020C 1215 nt7.76□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YNL190WYNL190W 615 nt7.76□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 CWC25YNL245C 540 nt7.76□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 TAZ1YPR140W 1146 nt7.76□□□□□ -1.17 RIP-Chip
PUF3Q07807 CBK1YNL161W 2271 nt7.76□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 MET30YIL046W 1923 nt7.76□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 SPS1YDR523C 1473 nt7.75□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 STF1YDL130W-A 261 nt7.75□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YDL158CYDL158C 309 nt7.75□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 AIM34YMR003W 597 nt7.75□□□□□ -1.17 RIP-Chip
PUF3Q07807 YOR343CYOR343C 327 nt7.75□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YAH1YPL252C 519 nt7.75□□□□□ -1.17 RIP-Chip
PUF3Q07807 PRC1YMR297W 1599 nt7.75□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 MLS1YNL117W 1665 nt7.74□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 MAL31YBR298C 1845 nt7.74□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YLR283WYLR283W 945 nt7.74□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 MIX17YMR002W 471 nt7.74□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 DSC3YOR223W 879 nt7.74□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 DSE3YOR264W 1293 nt7.74□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 HNM1YGL077C 1692 nt7.73□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 OSM1YJR051W 1506 nt7.73□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YDR327WYDR327W 327 nt7.73□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 BUD20YLR074C 501 nt7.73□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YOR041CYOR041C 432 nt7.73□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 BEM1YBR200W 1656 nt7.73□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YJL045WYJL045W 1905 nt7.72□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 MAF1YDR005C 1188 nt7.72□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YHR054CYHR054C 1065 nt7.72□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 YJR142WYJR142W 1029 nt7.72□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 RSA3YLR221C 663 nt7.72□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 ITR1YDR497C 1755 nt7.71□□□□□ -1.17
PUF3Q07807 FUS3YBL016W 1062 nt7.71□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 ERG24YNL280C 1317 nt7.71□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 BDS1YOL164W 1941 nt7.7□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 CKI1YLR133W 1749 nt7.7□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 RAI1YGL246C 1164 nt7.7□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 YGR011WYGR011W 327 nt7.7□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 PRE2YPR103W 864 nt7.7□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 snR34snR34 203 nt7.7□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 SLX1YBR228W 915 nt7.7□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 TCB1YOR086C 3561 nt7.7□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 PET494YNR045W 1470 nt7.69□□□□□ -1.18 RIP-Chip
PUF3Q07807 GUT1YHL032C 2130 nt7.69□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 CHA1YCL064C 1083 nt7.69□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 SKP1YDR328C 585 nt7.69□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 NCA3YJL116C 1014 nt7.69□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 LAS17YOR181W 1902 nt7.68□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 GTS1YGL181W 1191 nt7.68□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 PRY2YKR013W 990 nt7.68□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 YNL319WYNL319W 441 nt7.68□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 CRN1YLR429W 1956 nt7.68□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.67□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 MGM101YJR144W 810 nt7.67□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 HRB1YNL004W 1365 nt7.67□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 SVF1YDR346C 1446 nt7.67□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 CDC23YHR166C 1881 nt7.66□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 YGL081WYGL081W 963 nt7.65□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 YOL107WYOL107W 1029 nt7.65□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 PRM4YPL156C 855 nt7.65□□□□□ -1.18
PUF3Q07807 MSS51YLR203C 1311 nt7.64□□□□□ -1.19 RIP-Chip
PUF3Q07807 YCR049CYCR049C 447 nt7.64□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 NMA2YGR010W 1188 nt7.64□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 LIP2YLR239C 987 nt7.64□□□□□ -1.19 RIP-Chip
PUF3Q07807 ATP10YLR393W 840 nt7.64□□□□□ -1.19 RIP-Chip
PUF3Q07807 MSI1YBR195C 1269 nt7.64□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 AFG3YER017C 2286 nt7.64□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 NMD4YLR363C 657 nt7.63□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 YNL303WYNL303W 348 nt7.63□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 BAP3YDR046C 1815 nt7.63□□□□□ -1.19
PUF3Q07807 NDE1YMR145C 1683 nt7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.9 ms