Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 SRF1YDL133W 1314 nt5.77□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 STF1YDL130W-A 261 nt5.77□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 DMC1YER179W 1005 nt5.77□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt5.77□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 MSI1YBR195C 1269 nt5.77□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 NDE1YMR145C 1683 nt5.77□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 YNL040WYNL040W 1371 nt5.77□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 GPH1YPR160W 2709 nt5.75□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 YGL081WYGL081W 963 nt5.75□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 YPR127WYPR127W 1038 nt5.75□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 TDP1YBR223C 1635 nt5.74□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 PET117YER058W 324 nt5.74□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 YML079WYML079W 606 nt5.74□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 FCP1YMR277W 2199 nt5.74□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 KIN1YDR122W 3195 nt5.73□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 CIT2YCR005C 1383 nt5.73□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 DOC1YGL240W 753 nt5.73□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 ADH6YMR318C 1083 nt5.73□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 SNT309YPR101W 528 nt5.73□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 MCH2YKL221W 1422 nt5.73□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 HOG1YLR113W 1308 nt5.73□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 PUS7YOR243C 2031 nt5.72□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 MSG5YNL053W 1470 nt5.72□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 PIH1YHR034C 1035 nt5.72□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 ATP23YNR020C 813 nt5.72□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 RPL43AYPR043W 279 nt5.72□□□□□ -1.49
YHP1Q04116 CTA1YDR256C 1548 nt5.71□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 CCT3YJL014W 1605 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 IRC5YFR038W 2562 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 CDC13YDL220C 2775 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 PUP2YGR253C 783 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 THR1YHR025W 1074 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 RPR1RPR1 369 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 RTC4YNL254C 1206 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 GSH1YJL101C 2037 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 SLA2YNL243W 2907 nt5.7□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 HXT13YEL069C 1695 nt5.69□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 AMN1YBR158W 1650 nt5.69□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 MTR3YGR158C 753 nt5.69□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 MIX17YMR002W 471 nt5.69□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 DPM1YPR183W 804 nt5.69□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 CYB2YML054C 1776 nt5.69□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 CEM1YER061C 1329 nt5.69□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 YOR389WYOR389W 1875 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 GUT1YHL032C 2130 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 DLD1YDL174C 1764 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 HPT1YDR399W 666 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 NTG1YAL015C 1200 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 ARC35YNR035C 1029 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 TAH11YJR046W 1815 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 YJL045WYJL045W 1905 nt5.68□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 YPL247CYPL247C 1572 nt5.67□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 RQC1YDR333C 2172 nt5.67□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 SSC1YJR045C 1965 nt5.67□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 CMK2YOL016C 1344 nt5.67□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 CCR4YAL021C 2514 nt5.67□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 YCR049CYCR049C 447 nt5.66□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 ERS1YCR075C 783 nt5.66□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 YML122CYML122C 381 nt5.66□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 PTH2YBL057C 627 nt5.66□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 LAT1YNL071W 1449 nt5.65□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 PAM17YKR065C 594 nt5.65□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 HBN1YCL026C-B 582 nt5.65□□□□□ -1.5
YHP1Q04116 NFS1YCL017C 1494 nt5.64□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 MRPL28YDR462W 444 nt5.64□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YAL045CYAL045C 309 nt5.64□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 TRR2YHR106W 1029 nt5.63□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 COS10YNR075W 1125 nt5.63□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 TRS31YDR472W 852 nt5.62□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 RPL2BYIL018W 765 nt5.62□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YOX1YML027W 1158 nt5.62□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YNR014WYNR014W 639 nt5.62□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YOL099CYOL099C 492 nt5.62□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YPL067CYPL067C 597 nt5.62□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 UME1YPL139C 1383 nt5.62□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YLL066CYLL066C 3618 nt5.61□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 MIP1YOR330C 3765 nt5.61□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YPQ2YDR352W 954 nt5.61□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 TRR1YDR353W 960 nt5.61□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 PAC2YER007W 1557 nt5.61□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 MEU1YLR017W 1014 nt5.61□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 PRS4YBL068W 981 nt5.61□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YPQ1YOL092W 927 nt5.61□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 YBR241CYBR241C 1467 nt5.6□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 CST26YBR042C 1194 nt5.6□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 DML1YMR211W 1428 nt5.59□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 MSB3YNL293W 1902 nt5.59□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 SMK1YPR054W 1167 nt5.59□□□□□ -1.51
YHP1Q04116 MPE1YKL059C 1326 nt5.58□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 TUF1YOR187W 1314 nt5.58□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 URA1YKL216W 945 nt5.58□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.58□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.58□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.58□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.58□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 PLB2YMR006C 2121 nt5.58□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 RGD2YFL047W 2145 nt5.57□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 TUB1YML085C 1344 nt5.57□□□□□ -1.52
YHP1Q04116 AIM46YHR199C 933 nt5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms