Protein–RNA interactions for Protein: Q03330

GCN5, Histone acetyltransferase GCN5, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN5Q03330 PEX28YHR150W 1740 nt7.52□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 TPO1YLL028W 1761 nt7.51□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 ICE2YIL090W 1476 nt7.51□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 BDS1YOL164W 1941 nt7.51□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 DAL80YKR034W 810 nt7.51□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 AIM41YOR215C 558 nt7.51□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YDR306CYDR306C 1437 nt7.51□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YDR215CYDR215C 414 nt7.5□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 COX16YJL003W 357 nt7.5□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YML122CYML122C 381 nt7.5□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YMR253CYMR253C 1245 nt7.5□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 DIA4YHR011W 1341 nt7.5□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 OPI1YHL020C 1215 nt7.49□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 LGE1YPL055C 999 nt7.49□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YPC1YBR183W 951 nt7.49□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YER152CYER152C 1332 nt7.49□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 BNA3YJL060W 1335 nt7.49□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 EEB1YPL095C 1371 nt7.48□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.48□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.48□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YPL168WYPL168W 1293 nt7.48□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 ERV25YML012W 636 nt7.47□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 SPE3YPR069C 882 nt7.47□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 PMT7YDR307W 1989 nt7.47□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 ERR3YMR323W 1314 nt7.47□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 ERR1YOR393W 1314 nt7.47□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 ERR2YPL281C 1314 nt7.47□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 DCR2YLR361C 1737 nt7.47□□□□□ -1.21
GCN5Q03330 YJL211CYJL211C 444 nt7.46□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 YPL264CYPL264C 1062 nt7.46□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 NAF1YNL124W 1479 nt7.46□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 PMT1YDL095W 2454 nt7.46□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 PDA1YER178W 1263 nt7.45□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 YJL213WYJL213W 996 nt7.45□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 PET10YKR046C 852 nt7.45□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 YNL040WYNL040W 1371 nt7.45□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.44□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 SML1YML058W 315 nt7.44□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 snR30snR30 606 nt7.44□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 MRPL36YBR122C 534 nt7.44□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 MPH3YJR160C 1809 nt7.43□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 MPC1YGL080W 393 nt7.43□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 CCW12YLR110C 402 nt7.43□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 PLB3YOL011W 2061 nt7.43□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 PCL10YGL134W 1302 nt7.43□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 AVL9YLR114C 2295 nt7.43□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 VPS65YLR322W 315 nt7.42□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 DML1YMR211W 1428 nt7.42□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 NFS1YCL017C 1494 nt7.42□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 MSB3YNL293W 1902 nt7.41□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 YPQ2YDR352W 954 nt7.41□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 VAR1Q0140 1197 nt7.41□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 HXT13YEL069C 1695 nt7.41□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 CKB1YGL019W 837 nt7.4□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 RMA1YKL132C 1293 nt7.4□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 YNL234WYNL234W 1281 nt7.4□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 BIO3YNR058W 1443 nt7.4□□□□□ -1.22
GCN5Q03330 CAR2YLR438W 1275 nt7.39□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 ERG10YPL028W 1197 nt7.39□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 AQR1YNL065W 1761 nt7.38□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 CIT2YCR005C 1383 nt7.38□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 YLR162WYLR162W 357 nt7.38□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 RTC4YNL254C 1206 nt7.38□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 MRS3YJL133W 945 nt7.37□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 SRY1YKL218C 981 nt7.37□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 MET13YGL125W 1803 nt7.36□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 SIR2YDL042C 1689 nt7.36□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 YEL023CYEL023C 2049 nt7.36□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 SNF7YLR025W 723 nt7.36□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 YCL049CYCL049C 939 nt7.36□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 PDC5YLR134W 1692 nt7.35□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 RCF2YNR018W 675 nt7.35□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 NDJ1YOL104C 1059 nt7.35□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 YPR130CYPR130C 408 nt7.35□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 DPM1YPR183W 804 nt7.35□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 PZF1YPR186C 1290 nt7.35□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 TUB1YML085C 1344 nt7.34□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 YLR036CYLR036C 612 nt7.34□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 LDB7YBL006C 543 nt7.34□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 TAF4YMR005W 1167 nt7.34□□□□□ -1.23
GCN5Q03330 HXT9YJL219W 1704 nt7.33□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 POB3YML069W 1659 nt7.33□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.33□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 OCA1YNL099C 717 nt7.33□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 LEO1YOR123C 1395 nt7.32□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 CDC13YDL220C 2775 nt7.31□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.31□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 YOL046CYOL046C 675 nt7.31□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 GET4YOR164C 939 nt7.31□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 PUS7YOR243C 2031 nt7.31□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.3□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 GAT1YFL021W 1533 nt7.3□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 FCP1YMR277W 2199 nt7.3□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 RUP1YOR138C 2016 nt7.29□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 SUA5YGL169W 1281 nt7.29□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 NEM1YHR004C 1341 nt7.28□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 MPE1YKL059C 1326 nt7.28□□□□□ -1.24
GCN5Q03330 PMP3YDR276C 168 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.6 ms