Protein–RNA interactions for Protein: Q01560

NPL3, Nucleolar protein 3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPL3Q01560 ADE2YOR128C 1716 nt7.44□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 APM4YOL062C 1476 nt7.43□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 FRT1YOR324C 1809 nt7.43□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 MTC6YHR151C 1581 nt7.43□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 CTF3YLR381W 2202 nt7.43□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 PMT7YDR307W 1989 nt7.42□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 TOP3YLR234W 1971 nt7.42□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 DSE3YOR264W 1293 nt7.42□□□□□ -1.22 RIP-Chip
NPL3Q01560 PCL10YGL134W 1302 nt7.42□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 DST1YGL043W 930 nt7.41□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 CPR2YHR057C 618 nt7.41□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 TAF4YMR005W 1167 nt7.41□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 YMR253CYMR253C 1245 nt7.41□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 YLR358CYLR358C 564 nt7.4□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 RPR1RPR1 369 nt7.4□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 MOD5YOR274W 1287 nt7.4□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 BNA3YJL060W 1335 nt7.4□□□□□ -1.22
NPL3Q01560 YEL023CYEL023C 2049 nt7.4□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 POX1YGL205W 2247 nt7.4□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 HAM1YJR069C 594 nt7.39□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 MIX17YMR002W 471 nt7.39□□□□□ -1.23 RIP-Chip
NPL3Q01560 ELP6YMR312W 822 nt7.39□□□□□ -1.23 RIP-Chip
NPL3Q01560 AOS1YPR180W 1044 nt7.39□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 AFG2YLR397C 2343 nt7.39□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 YHP1YDR451C 1062 nt7.38□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 TES1YJR019C 1050 nt7.38□□□□□ -1.23 RIP-Chip
NPL3Q01560 CDA1YLR307W 906 nt7.38□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.38□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 YOL079WYOL079W 399 nt7.38□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 STE3YKL178C 1413 nt7.37□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 RBS1YDL189W 1374 nt7.37□□□□□ -1.23 RIP-Chip
NPL3Q01560 STS1YIR011C 960 nt7.37□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 RSA3YLR221C 663 nt7.37□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 DIT1YDR403W 1611 nt7.37□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 YER152CYER152C 1332 nt7.36□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 RRP43YCR035C 1185 nt7.36□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 EAF5YEL018W 840 nt7.36□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 YHR033WYHR033W 1272 nt7.36□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 LYS12YIL094C 1116 nt7.36□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 ERV2YPR037C 591 nt7.36□□□□□ -1.23 RIP-Chip
NPL3Q01560 YBR138CYBR138C 1575 nt7.36□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 HXT9YJL219W 1704 nt7.35□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 YNL295WYNL295W 1575 nt7.35□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 BIM1YER016W 1035 nt7.35□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.35□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 NCA3YJL116C 1014 nt7.35□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 HST2YPL015C 1074 nt7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
NPL3Q01560 SVF1YDR346C 1446 nt7.35□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 COS10YNR075W 1125 nt7.34□□□□□ -1.23
NPL3Q01560 PSA1YDL055C 1086 nt7.33□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 PRP40YKL012W 1752 nt7.33□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 YDR509WYDR509W 348 nt7.32□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 YJR142WYJR142W 1029 nt7.32□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 CTR1YPR124W 1221 nt7.32□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 AQR1YNL065W 1761 nt7.32□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 DRS1YLL008W 2259 nt7.32□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 POB3YML069W 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 YEL074WYEL074W 339 nt7.31□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 CRN1YLR429W 1956 nt7.31□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 NDE1YMR145C 1683 nt7.31□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 YNL040WYNL040W 1371 nt7.31□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 TFC6YDR362C 2019 nt7.3□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 CKB1YGL019W 837 nt7.3□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 DPH5YLR172C 903 nt7.3□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 YNL194CYNL194C 906 nt7.3□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 YNL234WYNL234W 1281 nt7.3□□□□□ -1.24 RIP-Chip
NPL3Q01560 YPC1YBR183W 951 nt7.3□□□□□ -1.24 RIP-Chip
NPL3Q01560 YPT10YBR264C 600 nt7.3□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 OSM1YJR051W 1506 nt7.3□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 PAP1YKR002W 1707 nt7.3□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 AVL9YLR114C 2295 nt7.29□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 YGL081WYGL081W 963 nt7.29□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 RAI1YGL246C 1164 nt7.29□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 PET10YKR046C 852 nt7.29□□□□□ -1.24 RIP-Chip
NPL3Q01560 CLB4YLR210W 1383 nt7.29□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 SPS1YDR523C 1473 nt7.29□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 MAS2YHR024C 1449 nt7.28□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 DOC1YGL240W 753 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
NPL3Q01560 Q0144Q0144 330 nt7.28□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 YJR115WYJR115W 510 nt7.28□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 PHA2YNL316C 1005 nt7.28□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 MSI1YBR195C 1269 nt7.28□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 TPO1YLL028W 1761 nt7.28□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 CCR4YAL021C 2514 nt7.28□□□□□ -1.24
NPL3Q01560 PPZ2YDR436W 2133 nt7.27□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 CBT1YKL208W 816 nt7.27□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 OPT1YJL212C 2400 nt7.27□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 MAM3YOL060C 2121 nt7.27□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 CHS5YLR330W 2016 nt7.27□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 GPI18YBR004C 1302 nt7.27□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 WHI4YDL224C 1950 nt7.26□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 STF1YDL130W-A 261 nt7.26□□□□□ -1.25 RIP-Chip
NPL3Q01560 NMA2YGR010W 1188 nt7.26□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 YML079WYML079W 606 nt7.26□□□□□ -1.25 RIP-Chip
NPL3Q01560 DSC3YOR223W 879 nt7.26□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 IES1YFL013C 2079 nt7.26□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 CNM67YNL225C 1746 nt7.25□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 ISY1YJR050W 708 nt7.25□□□□□ -1.25 RIP-Chip
NPL3Q01560 DAL80YKR034W 810 nt7.25□□□□□ -1.25
NPL3Q01560 ERV25YML012W 636 nt7.25□□□□□ -1.25
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