Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 EXG2YDR261C 1689 nt6.64□□□□□ -1.35
RRN9P53437 PAU21YOR394W 495 nt6.62□□□□□ -1.35
RRN9P53437 PAU22YPL282C 495 nt6.62□□□□□ -1.35
RRN9P53437 YPT10YBR264C 600 nt6.62□□□□□ -1.35
RRN9P53437 HAL5YJL165C 2568 nt6.61□□□□□ -1.35
RRN9P53437 SEC23YPR181C 2307 nt6.61□□□□□ -1.35
RRN9P53437 NUP84YDL116W 2181 nt6.61□□□□□ -1.35
RRN9P53437 KIN1YDR122W 3195 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 DSC3YOR223W 879 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 SGE1YPR198W 1632 nt6.6□□□□□ -1.35
RRN9P53437 STS1YIR011C 960 nt6.59□□□□□ -1.35
RRN9P53437 EFM1YHL039W 1758 nt6.59□□□□□ -1.35
RRN9P53437 TOS1YBR162C 1368 nt6.57□□□□□ -1.36
RRN9P53437 YJR142WYJR142W 1029 nt6.57□□□□□ -1.36
RRN9P53437 GPA1YHR005C 1419 nt6.57□□□□□ -1.36
RRN9P53437 HRB1YNL004W 1365 nt6.57□□□□□ -1.36
RRN9P53437 ACO1YLR304C 2337 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN9P53437 NCA3YJL116C 1014 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN9P53437 RQC1YDR333C 2172 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN9P53437 MHP1YJL042W 4197 nt6.56□□□□□ -1.36
RRN9P53437 DAL4YIR028W 1908 nt6.55□□□□□ -1.36
RRN9P53437 SKP1YDR328C 585 nt6.55□□□□□ -1.36
RRN9P53437 YDR476CYDR476C 675 nt6.55□□□□□ -1.36
RRN9P53437 MEU1YLR017W 1014 nt6.55□□□□□ -1.36
RRN9P53437 OSM1YJR051W 1506 nt6.55□□□□□ -1.36
RRN9P53437 RGT2YDL138W 2292 nt6.55□□□□□ -1.36
RRN9P53437 MCH2YKL221W 1422 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN9P53437 NMA2YGR010W 1188 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN9P53437 FUS3YBL016W 1062 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN9P53437 SUN4YNL066W 1263 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN9P53437 YOR343CYOR343C 327 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN9P53437 AGP2YBR132C 1791 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN9P53437 RDR1YOR380W 1641 nt6.54□□□□□ -1.36
RRN9P53437 ARC35YNR035C 1029 nt6.53□□□□□ -1.36
RRN9P53437 CYB2YML054C 1776 nt6.53□□□□□ -1.36
RRN9P53437 CDC7YDL017W 1524 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN9P53437 MTR3YGR158C 753 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN9P53437 SNT309YPR101W 528 nt6.52□□□□□ -1.37
RRN9P53437 MSI1YBR195C 1269 nt6.51□□□□□ -1.37
RRN9P53437 VTS1YOR359W 1572 nt6.51□□□□□ -1.37
RRN9P53437 PIL1YGR086C 1020 nt6.5□□□□□ -1.37
RRN9P53437 NTG1YAL015C 1200 nt6.5□□□□□ -1.37
RRN9P53437 CCW12YLR110C 402 nt6.5□□□□□ -1.37
RRN9P53437 PHO85YPL031C 918 nt6.5□□□□□ -1.37
RRN9P53437 YMR074CYMR074C 438 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN9P53437 YPL041CYPL041C 624 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN9P53437 AMN1YBR158W 1650 nt6.49□□□□□ -1.37
RRN9P53437 PET494YNR045W 1470 nt6.48□□□□□ -1.37
RRN9P53437 YJL213WYJL213W 996 nt6.48□□□□□ -1.37
RRN9P53437 TDP1YBR223C 1635 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 PGI1YBR196C 1665 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 YGL081WYGL081W 963 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 HGH1YGR187C 1185 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 RRN10YBL025W 438 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 YPR127WYPR127W 1038 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 TAH11YJR046W 1815 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 ERG12YMR208W 1332 nt6.47□□□□□ -1.37
RRN9P53437 ERS1YCR075C 783 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN9P53437 DOC1YGL240W 753 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN9P53437 YLL058WYLL058W 1728 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN9P53437 BUD20YLR074C 501 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN9P53437 AIM3YBR108W 2844 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN9P53437 GPH1YPR160W 2709 nt6.46□□□□□ -1.38
RRN9P53437 GSH1YJL101C 2037 nt6.45□□□□□ -1.38
RRN9P53437 RPL2BYIL018W 765 nt6.45□□□□□ -1.38
RRN9P53437 SMK1YPR054W 1167 nt6.45□□□□□ -1.38
RRN9P53437 ERG27YLR100W 1044 nt6.44□□□□□ -1.38
RRN9P53437 RSP5YER125W 2430 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 QCR6YFR033C 444 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 MIX17YMR002W 471 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 RPL43AYPR043W 279 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 SKY1YMR216C 2229 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 CEM1YER061C 1329 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 CCT3YJL014W 1605 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 HDA1YNL021W 2121 nt6.43□□□□□ -1.38
RRN9P53437 PET117YER058W 324 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN9P53437 IRC5YFR038W 2562 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN9P53437 CIT2YCR005C 1383 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN9P53437 ECM30YLR436C 3825 nt6.42□□□□□ -1.38
RRN9P53437 YBR241CYBR241C 1467 nt6.41□□□□□ -1.38
RRN9P53437 HBN1YCL026C-B 582 nt6.41□□□□□ -1.38
RRN9P53437 YLL066CYLL066C 3618 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 VBA5YKR105C 1749 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 DLD1YDL174C 1764 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 MRPL28YDR462W 444 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 DMC1YER179W 1005 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 YAL045CYAL045C 309 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 YLR358CYLR358C 564 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 RTC4YNL254C 1206 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 SDH8YBR269C 417 nt6.4□□□□□ -1.38
RRN9P53437 EMP65YER140W 1671 nt6.39□□□□□ -1.39
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