Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LBX1P52954 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LBX1P52954 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LBX1P52954 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LBX1P52954 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LBX1P52954 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LBX1P52954 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LBX1P52954 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LBX1P52954 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LBX1P52954 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LBX1P52954 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LBX1P52954 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LBX1P52954 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LBX1P52954 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LBX1P52954 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LBX1P52954 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LBX1P52954 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LBX1P52954 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LBX1P52954 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LBX1P52954 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LBX1P52954 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LBX1P52954 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LBX1P52954 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LBX1P52954 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LBX1P52954 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LBX1P52954 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LBX1P52954 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LBX1P52954 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LBX1P52954 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LBX1P52954 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LBX1P52954 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LBX1P52954 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LBX1P52954 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LBX1P52954 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LBX1P52954 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LBX1P52954 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LBX1P52954 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LBX1P52954 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LBX1P52954 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LBX1P52954 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LBX1P52954 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LBX1P52954 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LBX1P52954 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LBX1P52954 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LBX1P52954 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LBX1P52954 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LBX1P52954 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LBX1P52954 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LBX1P52954 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LBX1P52954 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LBX1P52954 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LBX1P52954 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LBX1P52954 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LBX1P52954 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LBX1P52954 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LBX1P52954 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LBX1P52954 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LBX1P52954 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LBX1P52954 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LBX1P52954 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LBX1P52954 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LBX1P52954 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LBX1P52954 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LBX1P52954 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LBX1P52954 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LBX1P52954 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LBX1P52954 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LBX1P52954 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LBX1P52954 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LBX1P52954 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LBX1P52954 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LBX1P52954 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LBX1P52954 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LBX1P52954 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LBX1P52954 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LBX1P52954 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LBX1P52954 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LBX1P52954 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LBX1P52954 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LBX1P52954 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LBX1P52954 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LBX1P52954 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LBX1P52954 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LBX1P52954 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LBX1P52954 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LBX1P52954 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LBX1P52954 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBX1P52954 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBX1P52954 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBX1P52954 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBX1P52954 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBX1P52954 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBX1P52954 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LBX1P52954 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LBX1P52954 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LBX1P52954 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LBX1P52954 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LBX1P52954 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LBX1P52954 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LBX1P52954 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms