Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 NUP84YDL116W 2181 nt6.63□□□□□ -1.35
DDI1P40087 SPS1YDR523C 1473 nt6.63□□□□□ -1.35
DDI1P40087 YHR131CYHR131C 2553 nt6.63□□□□□ -1.35
DDI1P40087 YIA6YIL006W 1122 nt6.63□□□□□ -1.35
DDI1P40087 ASN2YGR124W 1719 nt6.62□□□□□ -1.35
DDI1P40087 YBR241CYBR241C 1467 nt6.62□□□□□ -1.35
DDI1P40087 FPR2YDR519W 408 nt6.62□□□□□ -1.35
DDI1P40087 PHO85YPL031C 918 nt6.62□□□□□ -1.35
DDI1P40087 YPR127WYPR127W 1038 nt6.62□□□□□ -1.35
DDI1P40087 TAH11YJR046W 1815 nt6.62□□□□□ -1.35
DDI1P40087 TDP1YBR223C 1635 nt6.61□□□□□ -1.35
DDI1P40087 CBK1YNL161W 2271 nt6.61□□□□□ -1.35
DDI1P40087 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.61□□□□□ -1.35
DDI1P40087 YMR074CYMR074C 438 nt6.61□□□□□ -1.35
DDI1P40087 MLS1YNL117W 1665 nt6.61□□□□□ -1.35
DDI1P40087 NOG2YNR053C 1461 nt6.6□□□□□ -1.35
DDI1P40087 RPL43AYPR043W 279 nt6.6□□□□□ -1.35
DDI1P40087 OPI11YPR044C 354 nt6.6□□□□□ -1.35
DDI1P40087 GLN3YER040W 2193 nt6.59□□□□□ -1.35
DDI1P40087 TKL2YBR117C 2046 nt6.59□□□□□ -1.35
DDI1P40087 PGI1YBR196C 1665 nt6.59□□□□□ -1.35
DDI1P40087 CEM1YER061C 1329 nt6.59□□□□□ -1.35
DDI1P40087 YOS9YDR057W 1629 nt6.59□□□□□ -1.35
DDI1P40087 MRPL28YDR462W 444 nt6.59□□□□□ -1.35
DDI1P40087 YJL160CYJL160C 864 nt6.59□□□□□ -1.35
DDI1P40087 MIX17YMR002W 471 nt6.59□□□□□ -1.35
DDI1P40087 HOG1YLR113W 1308 nt6.58□□□□□ -1.36
DDI1P40087 IRC5YFR038W 2562 nt6.58□□□□□ -1.36
DDI1P40087 GTT3YEL017W 1014 nt6.58□□□□□ -1.36
DDI1P40087 YAL045CYAL045C 309 nt6.58□□□□□ -1.36
DDI1P40087 HBN1YCL026C-B 582 nt6.58□□□□□ -1.36
DDI1P40087 YLL058WYLL058W 1728 nt6.58□□□□□ -1.36
DDI1P40087 GSH1YJL101C 2037 nt6.57□□□□□ -1.36
DDI1P40087 SPR1YOR190W 1338 nt6.57□□□□□ -1.36
DDI1P40087 SKP1YDR328C 585 nt6.57□□□□□ -1.36
DDI1P40087 YIP4YGL198W 708 nt6.57□□□□□ -1.36
DDI1P40087 RCR1YBR005W 642 nt6.57□□□□□ -1.36
DDI1P40087 DLD1YDL174C 1764 nt6.57□□□□□ -1.36
DDI1P40087 OSM1YJR051W 1506 nt6.56□□□□□ -1.36
DDI1P40087 YBR284WYBR284W 2394 nt6.56□□□□□ -1.36
DDI1P40087 NAS6YGR232W 687 nt6.56□□□□□ -1.36
DDI1P40087 STS1YIR011C 960 nt6.56□□□□□ -1.36
DDI1P40087 THR1YHR025W 1074 nt6.55□□□□□ -1.36
DDI1P40087 YMR007WYMR007W 381 nt6.55□□□□□ -1.36
DDI1P40087 YLL066CYLL066C 3618 nt6.55□□□□□ -1.36
DDI1P40087 HXT2YMR011W 1626 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 PET117YER058W 324 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 CTF8YHR191C 402 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 COX16YJL003W 357 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 TDH1YJL052W 999 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 ERG27YLR100W 1044 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 ERV2YPR037C 591 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 CCT3YJL014W 1605 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 PNS1YOR161C 1620 nt6.54□□□□□ -1.36
DDI1P40087 AVT4YNL101W 2142 nt6.53□□□□□ -1.36
DDI1P40087 UTR5YEL035C 501 nt6.53□□□□□ -1.36
DDI1P40087 CCW12YLR110C 402 nt6.53□□□□□ -1.36
DDI1P40087 SDH8YBR269C 417 nt6.53□□□□□ -1.36
DDI1P40087 TOS1YBR162C 1368 nt6.53□□□□□ -1.36
DDI1P40087 QCR6YFR033C 444 nt6.52□□□□□ -1.37
DDI1P40087 SUR7YML052W 909 nt6.51□□□□□ -1.37
DDI1P40087 YNL200CYNL200C 741 nt6.51□□□□□ -1.37
DDI1P40087 FCY22YER060W-A 1593 nt6.51□□□□□ -1.37
DDI1P40087 GPH1YPR160W 2709 nt6.51□□□□□ -1.37
DDI1P40087 PSP2YML017W 1782 nt6.51□□□□□ -1.37
DDI1P40087 ECM38YLR299W 1983 nt6.5□□□□□ -1.37
DDI1P40087 ARP3YJR065C 1350 nt6.5□□□□□ -1.37
DDI1P40087 YJL213WYJL213W 996 nt6.5□□□□□ -1.37
DDI1P40087 CPT1YNL130C 1182 nt6.5□□□□□ -1.37
DDI1P40087 YOL099CYOL099C 492 nt6.5□□□□□ -1.37
DDI1P40087 HSP12YFL014W 330 nt6.49□□□□□ -1.37
DDI1P40087 OPI8YKR035C 642 nt6.49□□□□□ -1.37
DDI1P40087 YNR014WYNR014W 639 nt6.49□□□□□ -1.37
DDI1P40087 TUF1YOR187W 1314 nt6.49□□□□□ -1.37
DDI1P40087 BDF2YDL070W 1917 nt6.48□□□□□ -1.37
DDI1P40087 MSG5YNL053W 1470 nt6.48□□□□□ -1.37
DDI1P40087 CTA1YDR256C 1548 nt6.48□□□□□ -1.37
DDI1P40087 ERP2YAL007C 648 nt6.47□□□□□ -1.37
DDI1P40087 CYC8YBR112C 2901 nt6.47□□□□□ -1.37
DDI1P40087 DAL4YIR028W 1908 nt6.46□□□□□ -1.37
DDI1P40087 PPH22YDL188C 1134 nt6.46□□□□□ -1.38
DDI1P40087 HPT1YDR399W 666 nt6.46□□□□□ -1.38
DDI1P40087 RPL5YPL131W 894 nt6.46□□□□□ -1.38
DDI1P40087 CEF1YMR213W 1773 nt6.46□□□□□ -1.38
DDI1P40087 YPL247CYPL247C 1572 nt6.45□□□□□ -1.38
DDI1P40087 SWM1YDR260C 513 nt6.45□□□□□ -1.38
DDI1P40087 YJR142WYJR142W 1029 nt6.45□□□□□ -1.38
DDI1P40087 HRB1YNL004W 1365 nt6.44□□□□□ -1.38
DDI1P40087 HAC1YFL031W 717 nt6.44□□□□□ -1.38
DDI1P40087 DPM1YPR183W 804 nt6.44□□□□□ -1.38
DDI1P40087 CIT2YCR005C 1383 nt6.44□□□□□ -1.38
DDI1P40087 FRE5YOR384W 2085 nt6.43□□□□□ -1.38
DDI1P40087 PIL1YGR086C 1020 nt6.43□□□□□ -1.38
DDI1P40087 PAM17YKR065C 594 nt6.43□□□□□ -1.38
DDI1P40087 PAC2YER007W 1557 nt6.43□□□□□ -1.38
DDI1P40087 RGD2YFL047W 2145 nt6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms