Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CPS1P31327 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CPS1P31327 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CPS1P31327 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CPS1P31327 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CPS1P31327 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CPS1P31327 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CPS1P31327 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CPS1P31327 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
CPS1P31327 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CPS1P31327 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
CPS1P31327 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.38
CPS1P31327 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
CPS1P31327 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
CPS1P31327 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CPS1P31327 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CPS1P31327 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CPS1P31327 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CPS1P31327 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CPS1P31327 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CPS1P31327 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CPS1P31327 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CPS1P31327 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CPS1P31327 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CPS1P31327 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CPS1P31327 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CPS1P31327 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CPS1P31327 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CPS1P31327 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CPS1P31327 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CPS1P31327 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CPS1P31327 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CPS1P31327 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CPS1P31327 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CPS1P31327 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CPS1P31327 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CPS1P31327 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CPS1P31327 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPS1P31327 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPS1P31327 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPS1P31327 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CPS1P31327 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CPS1P31327 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CPS1P31327 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CPS1P31327 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CPS1P31327 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CPS1P31327 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CPS1P31327 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CPS1P31327 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CPS1P31327 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CPS1P31327 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CPS1P31327 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CPS1P31327 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CPS1P31327 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CPS1P31327 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CPS1P31327 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CPS1P31327 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CPS1P31327 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CPS1P31327 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CPS1P31327 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CPS1P31327 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CPS1P31327 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CPS1P31327 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CPS1P31327 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CPS1P31327 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CPS1P31327 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CPS1P31327 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CPS1P31327 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CPS1P31327 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CPS1P31327 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CPS1P31327 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CPS1P31327 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CPS1P31327 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CPS1P31327 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CPS1P31327 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CPS1P31327 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CPS1P31327 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CPS1P31327 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CPS1P31327 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CPS1P31327 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CPS1P31327 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CPS1P31327 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CPS1P31327 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CPS1P31327 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CPS1P31327 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CPS1P31327 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CPS1P31327 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CPS1P31327 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CPS1P31327 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CPS1P31327 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CPS1P31327 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CPS1P31327 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CPS1P31327 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CPS1P31327 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CPS1P31327 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CPS1P31327 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CPS1P31327 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CPS1P31327 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CPS1P31327 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CPS1P31327 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms