Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RXRBP28702 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RXRBP28702 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RXRBP28702 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RXRBP28702 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RXRBP28702 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RXRBP28702 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RXRBP28702 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RXRBP28702 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RXRBP28702 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RXRBP28702 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RXRBP28702 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RXRBP28702 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RXRBP28702 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RXRBP28702 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RXRBP28702 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RXRBP28702 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RXRBP28702 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RXRBP28702 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RXRBP28702 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RXRBP28702 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RXRBP28702 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RXRBP28702 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RXRBP28702 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RXRBP28702 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RXRBP28702 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RXRBP28702 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RXRBP28702 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RXRBP28702 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RXRBP28702 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RXRBP28702 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RXRBP28702 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RXRBP28702 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RXRBP28702 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RXRBP28702 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RXRBP28702 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RXRBP28702 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RXRBP28702 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RXRBP28702 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RXRBP28702 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RXRBP28702 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RXRBP28702 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RXRBP28702 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RXRBP28702 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RXRBP28702 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RXRBP28702 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RXRBP28702 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RXRBP28702 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RXRBP28702 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RXRBP28702 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RXRBP28702 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RXRBP28702 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
RXRBP28702 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RXRBP28702 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RXRBP28702 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RXRBP28702 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RXRBP28702 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RXRBP28702 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RXRBP28702 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RXRBP28702 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RXRBP28702 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RXRBP28702 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RXRBP28702 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RXRBP28702 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RXRBP28702 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RXRBP28702 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RXRBP28702 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RXRBP28702 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RXRBP28702 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RXRBP28702 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RXRBP28702 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RXRBP28702 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RXRBP28702 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RXRBP28702 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RXRBP28702 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RXRBP28702 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RXRBP28702 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RXRBP28702 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RXRBP28702 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RXRBP28702 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RXRBP28702 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RXRBP28702 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RXRBP28702 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RXRBP28702 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RXRBP28702 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RXRBP28702 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RXRBP28702 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RXRBP28702 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RXRBP28702 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RXRBP28702 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RXRBP28702 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RXRBP28702 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RXRBP28702 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RXRBP28702 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RXRBP28702 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RXRBP28702 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RXRBP28702 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RXRBP28702 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RXRBP28702 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RXRBP28702 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms