Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
POLD1P28340 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
POLD1P28340 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLD1P28340 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLD1P28340 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLD1P28340 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLD1P28340 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLD1P28340 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLD1P28340 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLD1P28340 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLD1P28340 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLD1P28340 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLD1P28340 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLD1P28340 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLD1P28340 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLD1P28340 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLD1P28340 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
POLD1P28340 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLD1P28340 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
POLD1P28340 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
POLD1P28340 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLD1P28340 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
POLD1P28340 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
POLD1P28340 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLD1P28340 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLD1P28340 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLD1P28340 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLD1P28340 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLD1P28340 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLD1P28340 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLD1P28340 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLD1P28340 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLD1P28340 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLD1P28340 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLD1P28340 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLD1P28340 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLD1P28340 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLD1P28340 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLD1P28340 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLD1P28340 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLD1P28340 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLD1P28340 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLD1P28340 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLD1P28340 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLD1P28340 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLD1P28340 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLD1P28340 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
POLD1P28340 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
POLD1P28340 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
POLD1P28340 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLD1P28340 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLD1P28340 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLD1P28340 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLD1P28340 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLD1P28340 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
POLD1P28340 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLD1P28340 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLD1P28340 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLD1P28340 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
POLD1P28340 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLD1P28340 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLD1P28340 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLD1P28340 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLD1P28340 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
POLD1P28340 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLD1P28340 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLD1P28340 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
POLD1P28340 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
POLD1P28340 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
POLD1P28340 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLD1P28340 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLD1P28340 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
POLD1P28340 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLD1P28340 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLD1P28340 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLD1P28340 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLD1P28340 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLD1P28340 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
POLD1P28340 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLD1P28340 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLD1P28340 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLD1P28340 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLD1P28340 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLD1P28340 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLD1P28340 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLD1P28340 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLD1P28340 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLD1P28340 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLD1P28340 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLD1P28340 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLD1P28340 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLD1P28340 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLD1P28340 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLD1P28340 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
POLD1P28340 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLD1P28340 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLD1P28340 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLD1P28340 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
POLD1P28340 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POLD1P28340 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms