Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GLI3P10071 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GLI3P10071 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GLI3P10071 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GLI3P10071 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GLI3P10071 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
GLI3P10071 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GLI3P10071 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GLI3P10071 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GLI3P10071 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GLI3P10071 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.82■■■■□ 3
GLI3P10071 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
GLI3P10071 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GLI3P10071 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GLI3P10071 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GLI3P10071 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GLI3P10071 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GLI3P10071 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GLI3P10071 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GLI3P10071 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GLI3P10071 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GLI3P10071 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.8■■■■□ 3
GLI3P10071 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GLI3P10071 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GLI3P10071 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GLI3P10071 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GLI3P10071 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GLI3P10071 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GLI3P10071 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GLI3P10071 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GLI3P10071 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GLI3P10071 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GLI3P10071 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GLI3P10071 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.77■■■■□ 3
GLI3P10071 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GLI3P10071 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
GLI3P10071 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GLI3P10071 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GLI3P10071 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GLI3P10071 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GLI3P10071 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GLI3P10071 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
GLI3P10071 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
GLI3P10071 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GLI3P10071 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GLI3P10071 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GLI3P10071 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GLI3P10071 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GLI3P10071 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GLI3P10071 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GLI3P10071 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GLI3P10071 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GLI3P10071 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GLI3P10071 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GLI3P10071 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GLI3P10071 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GLI3P10071 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GLI3P10071 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GLI3P10071 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GLI3P10071 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GLI3P10071 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GLI3P10071 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GLI3P10071 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
GLI3P10071 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GLI3P10071 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GLI3P10071 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GLI3P10071 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GLI3P10071 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GLI3P10071 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GLI3P10071 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GLI3P10071 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GLI3P10071 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GLI3P10071 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GLI3P10071 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GLI3P10071 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GLI3P10071 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GLI3P10071 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GLI3P10071 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GLI3P10071 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLI3P10071 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLI3P10071 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLI3P10071 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLI3P10071 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLI3P10071 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GLI3P10071 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GLI3P10071 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GLI3P10071 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GLI3P10071 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GLI3P10071 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GLI3P10071 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GLI3P10071 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
GLI3P10071 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GLI3P10071 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GLI3P10071 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GLI3P10071 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GLI3P10071 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GLI3P10071 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GLI3P10071 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GLI3P10071 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GLI3P10071 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms