Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCDC2BA2VCK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCDC2BA2VCK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DCDC2BA2VCK2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCDC2BA2VCK2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms