Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPARGC1BQ86YN6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPARGC1BQ86YN6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms