Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEC24CP53992 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SEC24CP53992 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms